不管是人還是狗貓，我們都是與一大群微生物共存在這個世界上，你一定也很常聽到［常在菌］這幾個字。腸道有常在菌，皮膚表層有常在菌，甚至口、鼻腔乃至於牙周也有常在菌的存在。
Microbiota指的包含了細菌與真核生物等微生物，不包含病毒之類的非生命體。 Microbiome指的是微生物組，包含病毒，像一個生態系般的存在，也是動態系統。
目前被研究的最多的就是腸道微生物組，搭上近期抗生素議題的潮流，我們發現很多腸胃道問題並不需要使用抗生素治療，反之則是使用一些益生菌（Probiotics）或益菌生（Prebiotic），或是調整飲食來控制。
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舉裡來說：身體就像是一個國家，內部有很多小型邦聯。
今天某邦聯內部陷入治安混亂，為了矯正視聽，以往的做法，就是直接丟一顆核彈（抗生素）弭平紛爭，並期待下一代的人民可以長得來乖乖地。
另外，你也可以選擇派一些警察或是品行良好的行政人員（益生菌），制定政策維持秩序。或是幫原有的優質人員加薪（益菌生）。再不然就是直接找一堆品行優良的人移民進去（糞便移植）。
同時，也可以去看為什麼這些人這麼憤怒，是否在福利政策，或生活上有甚麼可以改善的（飲食調整）。
所以，初步的作法不是先丟核彈讓他直接變滿滿的大平原，而是循循善誘。但是，當這些暴民已經快要造成某邦聯的滅亡時，很有可能會連帶影響到整個國家，這時候才會需要積極介入（抗生素）。
講到這邊，我們應該有初步的認知：微生物並不是都對我們有害，而是我們身體的一部分。
因此這些居民們的組成，還有分布，數量變化，對我們來說都至關重要。這也是目前治療急性、慢性下痢、發炎性腸病（IBD）等問題的新趨勢。
菌叢失調 Dysbiosis
或是菌群紊亂、菌叢混亂，指的就是這些微生物組的生態系失去平衡。如果以地球來舉例，就像是全球暖化或是藻礁生態系受到破壞之類的狀況。
目前有越來越多研究指出，有不少疾病都和Dysbiosis有關，在這些疾病都可以發現菌叢比例上的改變，而這樣的改變或許就給了我們治療的新方向。
狗貓的口腔菌叢
因為科技的進步，狗貓的口腔菌叢在近期風風火火的被定序出來，直接抓幾個重點給大家：
- 健康狗貓的口腔菌叢以陰性菌為主，牙周病時則以陽性菌為主。人則是相反。
- 牙周病和某種致病菌種忽然出現無關，而是與菌叢比例改變有關，而這個改變也可能跟口腔中環境變化（比如牙齦發炎）有關。
- 牙周病的狗：Peptostreptococcaceae sp.及Treponema sp.比例增加最多，貓則是Treponema sp.，但改變相對於狗較微小，而是豐富性下降較明顯。
- 狗的牙齦上牙菌斑菌叢豐富性最高，口水中豐富性最低。
牙科的菌叢混亂該如何治療？
我們先前曾經提過，牙周病不單只跟細菌們有關，也跟宿主本身的免疫反應息息相關：
同時，我們必須了解，口腔中的細菌大多以牙菌斑形式附著在牙齒上。牙菌斑本身是生物膜（Biofilm），有極高抵抗抗生素的能力，且容易讓外來化學物質難以穿透，同時在裡面的細菌可以交換資訊，互通有無，一起進化。
既然抗生素效果不佳，給了之後，又會像核彈一樣，擾亂菌叢造成混亂，那在治療上該如何是好？
對，對對對，就是刷牙。直接移除牙菌斑，減少細菌數量，讓資源有效分配，使族群回歸正常（好像薩諾斯彈指）。
目前美國獸醫牙科學會（AVDC）也建議，除非是嚴重口腔感染，同時有全身性疾病、免疫問題的病患，否則不應該將抗生素用來當成單一的治療，也不應該沒事拿來作為預防性使用。
牙周病的抗生素選擇
那如果真的要用抗生素呢？該怎麼選擇？一般來說，我們使用抗生素的時機都是在牙科治療時的預防性使用。
預防什麼呢？預防細菌們，因為牙科治療時的微小傷口引發細菌移行（Bacterial translocation），進而引發細菌性心內膜炎。
所以我們在選擇抗生素上，應當選擇對細菌性心內膜炎有效的抗生素，而非牙周致病菌的抗生素。比如說：Streptococcus canis, Enterobacterales。
以下則是常用的幾種抗生素選擇：
- Ampicillin：對Streptococci效果好
- Clindamycin：對厭氧菌及Streptococci效果好
- Cefazolin：對Streptococci及部分陰性菌效果好
無論是上述三種的哪一種，都是非常前線的抗生素，因此如果真的要使用到很後線的藥物，可能真的要好好思考是否真的必要，還是只是想要。
結論
微生物組（Microbiome）的概念與研究是目前正夯的主題，不管在消化道或是牙科都有很多新的進展。盡管有些細菌的確是致病菌，但其實和疾病因果關係也無法被完整證明。因此我們可以靜待更多研究，然後，好好刷牙。
吃了很久的抗生素
嘴巴還是一樣臭
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